История начинается в неспокойном мире, где могущественная организация под названием «Тамплиеры» веками тайно управляет человечеством, стремясь к абсолютному контролю через искоренение свободной воли. Им противостоят ассасины — хранители свободы, мастера скрытности и ближнего боя, чья философия основана на идее, что лишь в хаосе может родиться истинная свобода. В центре этого извечного противостояния оказывается Каллум Линч, молодой человек, проживающий свою жизнь на улицах современного города, не подозревающий о своем уникальном наследии. После трагического инцидента он оказывается втянут в конфликт, который намного старше его самого. Ученые из корпорации «Абстерго», современной маски тамплиеров, предлагают ему шанс разобраться в своем прошлом с помощью революционной технологии «Анимус». Это устройство позволяет пользователю переживать генетические воспоминания своих предков, и для Каллума такой предок — Агилар де Нерха, легендарный ассасин, действовавший в Испании эпохи инквизиции. Погружаясь в воспоминания Агилара, Каллум начинает не только осваивать смертоносные навыки и паркур-способности ассасинов, но и постигать суть их многовековой войны с тамплиерами. Каждое погружение в прошлое приближает его к раскрытию тайны местонахождения могущественного артефакта — Яблока Эдема, который способен подчинить волю всего человечества. Однако в реальном мире Каллум понимает, что оказался пешкой в опасной игре, и ему предстоит сделать судьбоносный выбор: продолжать ли быть инструментом в руках «Абстерго» или принять свое истинное предназначение и присоединиться к современным ассасинам, которые вышли из тени, чтобы дать ему шанс. Его личное путешествие превращается в гонку со временем, где уроки прошлого становятся ключом к спасению будущего, а внутренняя борьба между долгом и свободой определяет не только его судьбу, но и баланс сил в мире, не подозревающем о войне, идущей в его тени.